忍者の末裔であるマトラは、なんとか師匠から最終奥義を教えてもらおうと、修行に励んでいる。しかし、簡単にはいかない。そんな時、5年ぶりに師匠の前に姿を現したキサラ。マトラの姉で、5年前に姿を消していた彼女が帰ってきた。訝しがる師匠・半蔵。半蔵の目に入ってきたのは、悪の呪いに犯されたキサラの左腕だった。半蔵が捕らわれたことを知ったマトラ、師匠の許に急ぐ。行く手を阻む忍者たちをなぎ倒し、ついに敵のアジトに辿り着いたマトラを出迎えたのは、姉・キサラの強烈な攻撃だった。最終奥義を廻る、熾烈な争いの末にマトラが手にいれたものは…？