現実とはほんの少し違う別の世界…。世界は戦争により東西にわかれ、それぞれが互いの主張を掲げながらそれぞれの平和という道を歩んでいた。前回のサイボーグ事件から数ヵ月後。病気や老齢で弱った体を修復する新細胞を開発する西側の大企業「ミツオカ製薬」の重役が暗殺され、その被害はリオの友人で新細胞の研究者・マコにまで及んだ。再び要人警護の任に就くリオとメイ。しかし、マコを狙うテロリストは1人だけではなかった。走行中の車を突如襲う謎の武装兵たち。飛び交う銃弾の中の戦闘。何とかマコを守りきったと思ったその時、冷たい瞳の美しい暗殺者が彼女達に襲い掛かる。マコが狙われる理由とは？テロリスト達の正体は？そして、全ての謎を知る男は音も立てずに収容所から脱走するのであった…。