現代忍者たちにも伝わる「黄金の秘宝」伝説。それには莫大で強大な財宝の秘密も隠されているという。「黄金の秘宝」を狙って闇の組織イロードが再び暗躍を始めた。忍者特捜ジャスティーウインドのメンバーたちに秘宝の手がかりとなる巻物をイミテーションと交換せよとの指令が下される。味方の保管施設に潜入するジャスティーウインドのメンバーたちの前に巻物を手にしたイロードのガマ魔忍ゲルゲッソー一味が現れる。ジャスティーウインドに変身して戦う三人。戦いの中、隙をついてゲルゲッソーから巻物を奪うレッドウインド。巻物をブルーウインドにパスし、ブルーウインドはその場を離れる。が、巻物を追うゲルゲッソーに追いつかれ、敵に取り囲まれてしまう。ブルーウインド一人で、ゲルゲッソー一味と戦うのだが、ゲルゲッソーの舌攻撃の前に苦戦して絶体絶命のピンチに陥ってしまう。そこに謎の青年忍者が現れ、ブルーウインドは助けられなんとか難を逃れるのだった。しかし、その戦いの中で本物の巻物が行方不明になってしまった。奪われた可能性がある巻物を取り戻そうと、三人は手分けして情報を集めるのだが…。