闘忍学校の生徒・御影志乃は、忍びの実力はピカイチで正義感も強い生徒だが、その性格がマイペースなため落ちこぼれというレッテルを貼られていた。闘忍クラスの卒業試験の日、遅刻する志乃を待つ教頭先生のもとに、日本を支配しようとする邪悪な凶忍集団ソウマの下忍たちが現れる。教頭は気配を察知して隠れるが、内密なはずの試験を知られたことに不安を感じ、到着した御影志乃に特別に闘忍クラスの卒業を認め、特殊戦忍隊シャドウレンジャーのシャドウブルーになることを任命する。変身した志乃はシャドウブルーとなり、襲ってくる下忍たちと戦うのだが、慣れない実戦のため攻撃を躊躇してしまう。危ういところを教頭と共に切り抜けるが敵に囲まれつつある二人は、二手に別れて敵戦力を分散させることに。その後難なくブルーは敵を撃退するが、あまりの容易さに疑念を感じ、教頭の側に強敵が集中しているのではと案じ、敵地に戻ってしまう。しかしそれこそがブルーの優しさに漬け込んだソウマの卑劣な罠だった…。［BAD END］