悪人が現れるとマイティーハニーとなって活躍する玲於奈だったが、知り合いのルポライター田辺が、なんでもマイティーハニーが解決するので、人々の依存心が強くなって、良いことはないという意見を聞き、ショックを受けて、なるべく変身しない事件を解決しようと考え、変身を控えるようになる。そして、玲於奈は、田辺と組んで悪徳業者の狭山興業が、毒性の高い廃液を不法に投棄している事実を知り、潜入取材をするが狭山興業の黒幕は悪徳宇宙人二人組だったのだ！玲於奈はマイティーハニーに変身して戦うが悪徳宇宙人は廃液から造った液体を注射しミュータントに変身する。さすがのマイティーハニーも怪力ミュータントの一撃をくらい、昏倒し二人は捕まってしまう。玲於奈は拷問を受けるが、脱出した田辺に救出され窮地を切り抜ける。玲於奈は、ミュータント怪人が大統領の命を狙っていることを知り、ミュータント怪人と再び戦う事に！