宇宙連邦認定のキューティーハンター・リリィは1億ディラーの賞金がかかっている宇宙怪人、ウォンとテッドを地球まで追いかけ、激しいバトルをしていた。それを撮影だと思い観ている大学生の百合子…。リリィがピンチになり怪人に殴られているのを観て、思わずしゃしゃり出てしまう。案の定、ウォンとテッドに捕まり、百合子は食べられそうになる。助けに行くリリィ。しかし、どうすることも出来なくなりついに、ブレスレットを百合子に投げる！「ハンタークロスオン！！」大学生の百合子の身体が小さくなり、キューティーハンター・ユリコに変身したのだ！ユリコもリリィに協力し、何とかウォンだけ、倒すことに成功する。しかし、その背後にはテッドの赤い目が…。

ウォンを倒したものの、殺してしまい、賞金は手に入らずじまいのリリィ…。今度は何とか、テッドを生け捕りにしようと夜の街をさ迷い歩くが、見つからない…。そんな折、テッドは殺されたウォンの仇を討つべく、地球人を戦闘員に仕立て上げ、虎視眈々とキューティーハンターズ抹殺を狙っていた…。そして、まんまとリリィをおびき出すことに成功したテッドは、リリィを完全に制圧し、次はユリコの番だと、去っていく。テッドとユリコの対決！しかし、パワーアップしたテッドに痛めつけられていく。どうなるキューティーハンターズ！！テッドを捕まえることが出来るのか！！